La scelta delle materie prime per fertilizzanti organici e fertilizzanti bio-organici può essere costituita da vari letame zootecnico e rifiuti organici.La formula produttiva base varia a seconda delle diverse tipologie e materie prime;le materie prime di base sono: sterco di pollo, sterco di anatra, sterco d'oca, sterco di maiale, sterco di bovini e ovini, paglia di colture, fango filtrante dell'industria dello zucchero, bagassa, residui di barbabietola da zucchero, cereali di distillazione, residui di medicinali, residui di furfurale, residui di funghi, fagioli torta, torta di semi di cotone, torta di colza, carbone d'erba, ecc.